付巧妹最新娱乐体验_付巧妹的丈夫是谁(2024年12月深度解析)
3.3万年前至3千年,古人类之谜 这篇论文来自付巧妹团队,发表在2021年的Cell正刊上。如果你对古人类起源感兴趣,可以看看我之前的“我们从哪里来”系列。 首先,样本来源非常重要。之前欧洲以外地区的古人类遗骸样本非常缺乏。随着付巧妹、王传超等学者回国,中国样本逐渐被挖掘和分析。前几天还提到印度也开始相关挖掘工作。 DNA提取技术是个技术活,感兴趣的可以看看大卫赖克的书,全球也就几个团队能做到。 到底分析什么?是常染色体、性染色体、覆盖的区域、SNP数量,还是微生物相关的数据?这些都决定了结果的丰富度和可信度。 接下来简单看看这篇论文: 这篇论文提取了曾生活在黑龙江松嫩平原、时间跨度为33,590–3,420年的25个古人类的骨头DNA,建库测序SNP覆盖率很参差,几万到几十万个SNP不等。虽然数据质量一般,但考虑到这么久远的样本,已经很难得了。 其中重点对阿穆尔地区一位人类女性(AR33K)的基因组信息进行深度分析。这位女性预估是和田园洞人一支,目前还无法确认和现代中国人的关系密切程度。 图3展示了25个古人类样本的分布,主要在现代的黑龙江地区,同时也直观对比了之前发表的附近古人类样本的地点。 然后重点讲一个古人类研究里用的统计手段——四群体检验用于血缘亲疏关系。例如,图4显示与黑猩猩相比,尼安德特人的祖先曾发生一个突变T,而尼安德特人和欧洲人所共享的突变总量里,比非洲人的数目要多9%的T,则说明历史上尼安德特人和欧洲人祖先发生过混血。而和非洲人则说不好。 付巧妹的研究也用了这个思路,并用f3 value来比较:f3(P1, P2, P3, 外群),是研究P1(上面的尼安德特人)和P2(上面的欧洲人)两个人群是不是发生过混血,对比P3(类似上面的非洲人),和外群(上面的黑猩猩)。 再来看结果: 图5显示,颜色越深数字越小,混血比例越小。这里说明33K年前的AR33K女性和北京田园洞人发生最多的混血概率(距离1K公里以外!)。北京田园洞人也是如此。 图6展示了AR33K和欧亚大陆上其他的古人类样本的血缘亲疏关系。 另外还有一些结论,我们体感不强就不赘述了,例如:现代东亚人重要的EDAR基因上的V370A突变,是在约2W年前开始出现的,AR33K和田园洞人都没。这个突变可能用于补充乳汁中的维生素D含量或者调节体温出汗。 #我们从哪里来
「民主党派」【两位党派成员获发展中国家科学院奖】11月14日,「发展中国家科学院」(TWAS)奖揭晓,来自中国、印度、巴西、马来西亚等13个国家的25位学者获得表彰,其中8位中国学者获奖,分别是林晨、付巧妹、黄三文、刘默芳、曾杰、傅吉祥、丁洪、方创琳。团结君注意到,在8位中国获奖者中,有两位民主党派成员——网页链接
古人如何驯化微生物?新疆奶酪样本揭秘 古人驯化动物为己所用的历史我们早已耳熟能详,但你知道吗?他们其实也驯化了微生物!最近,我国科研团队在新疆小河墓地出土的3500年前“奶酪”样本中发现了惊人秘密。 这项研究首次实现了对古代奶制品遗存的宏基因组研究,成果于9月25日在《Cell》杂志上发表,并被评为重点推荐论文。研究团队围绕古代发酵奶制品展开系统研究,揭示了新疆小河墓地出土的“最古老奶酪”背后的微生物奥秘。 付巧妹团队联合多家单位,包括新疆文物考古研究所、新疆大学和国家文物局考古研究中心等,对奶酪样本进行了深入分析。结果显示,这种奶酪制品源自开菲尔酸奶,由开菲尔粒(类似酒曲)在奶中发酵而成。 通过自主设计的乳酸菌全基因组位点探针,研究团队成功将奶酪样品中的乳酸菌DNA从0.43%至0.55%富集提升至64%至80%,从而实现了第一例古代全基因组研究。 젧 究发现,样本中的开菲尔乳酸菌基因组与欧洲菌株有所不同。这意味着奶制品发酵技术的传播很可能伴随着人类的迁徙和互动。论文共同第一作者刘逸宸表示,开菲尔乳酸菌支系的分化很可能是其共同祖先最初被驯化后在不同人群的传播所致。 国际专家对这项研究给予了高度评价,认为这是古DNA研究中的罕见发现,为欧亚草原中部人群的迁徙交流与微生物驯化历史带来了新认识。 为我国科学家们的优秀研究成果点赞!这一发现不仅展示了古人对微生物的驯化能力,也为现代微生物学研究提供了宝贵资料。
浙大动科保研全攻略:纠结与收获 浙大,对于杭州的学生来说,简直是理想的归宿。虽然我对动科的兴趣不大,但浙大的吸引力实在难以抗拒。 🠥䏤姚纠结时刻:浙大动科的夏令营时间安排得让人头疼,很多学校都在这几天举行活动。我撞了川大和北古所付巧妹研究员的夏令营,真是纠结得不行。 렧港校区探访:动科在紫金港校区,校区很大,走路会有点累。夏令营提供了大巴车服务。我是本地人,所以没有住校,因为听说宿舍条件不太好。 ️ 实验室探秘:院楼有点老旧,实验室设施也显得有些陈旧。有些设备看起来已经老得快要散架了。不过,听说部分实验室已经在重新装修了。 颀련师印象:我主要关注遗传育种方向,这里的大组主要做生信。实验室分工非常明确,有些老师甚至不会做PCR,只需要服务器。这让我有些意外,因为我的本科学校搞生信和实验的是同一个组,工作流水线化。我选的老师主要做基因编辑,人非常好,甚至还会帮我分析面试的难度和侧重点,真是特别真诚的老师! 面试经历:面试内容包括PPT展示、英语测试、思政问答和随机提问。问题比较主观,英语部分会有专业词汇。老师们不会太刁难,氛围还算轻松。 最后的抉择:浙大动科最后给我提供了专硕或直博的offer。我没有选择,原因有几个:首先,我对动科的兴趣不大,也不想读专硕,心仪的导师没有博士指标;其次,实验室环境和我的理想有偏差;最后,老师之间和各个组之间的人际关系也让我有些顾虑。 ᠥ詀择院校和导师时,建议大家多方面考量,比如导师的水平、话语权、实验室配置等。可以多问一下学姐学长,了解更多信息!
【新疆“小河公主”的奶酪,与今天的奶酪有何不同?】「科技前线」 在塔克拉玛干沙漠之中,隐藏着一个古老而神秘的墓地——小河墓地,这里埋藏着佩戴奇异装饰的木乃伊“小河公主”。在“小河公主”颈部、胸部和身侧散布着的奶酪块引人注目。 这些古老的奶酪是如何制作出来的?与我们今天的奶酪有何不同?它们背后又隐藏着哪些不为人知的历史? 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古遗传学研究团队(付巧妹团队)从这些世界最古老的奶酪中获取高质量的古代乳酸菌基因组,用独特的发酵古微生物视角回答了这些问题。相关成果近日发表于《细胞》。 一“技”之长 用开菲尔粒发酵制作奶酪 小河墓地出土的奶酪块已有3500年之久,颜色偏乳黄,质地疏松,形状呈不规则多孔状。 研究从三例奶酪样本中鉴定发现了丰富的与发酵相关的微生物群落,如马乳酒样乳杆菌(即下文中的开菲尔乳酸菌)和瑞士乳杆菌等细菌菌株,以及马克斯克鲁维酵母和库德里阿兹威氏毕赤酵母等真菌菌株。 这些乳酸菌和酵母菌正是典型的开菲尔粒所包含的菌株,这表明新疆小河居民在青铜时代已经利用开菲尔粒来制作开菲尔酸奶或奶酪,显示出利用发酵微生物来发酵奶制品的古老智慧和制作工艺。 发酵的价值不仅仅是延长奶制品的保存期限,变换风味,更重要的是在制作过程里大大降低了乳糖的含量,让乳糖不耐受的小河居民也能轻松食用。 “交际”广泛 用“草原”羊奶制作奶酪 通过提取分析奶酪样本中的哺乳动物线粒体DNA,研究发现小河居民是用牛或者山羊这些家畜来产奶并制作奶酪的。 值得一提的是,小河居民用来产奶的山羊并不是东亚内陆的驯化山羊,而是新石器时代以后伴随草原牧民迁徙而广泛分布在欧亚大陆的一个支系,这很可能是青铜时代小河居民与草原牧民互动交流的结果,也折射出小河地区畜牧业发展可能的来源。 乐于“分享” 让开菲尔发酵技术远播内陆 通过从奶酪样本中重建古代开菲尔乳酸菌基因组,并结合欧亚大陆不同地区现代开菲尔乳酸菌基因组进行系统发育关系分析,研究发现开菲尔乳酸菌存在欧洲和东亚两个重要支系。 欧洲支系主要包括来自欧洲以及亚洲沿海和岛屿地区的菌株,符合从高加索扩散到欧洲及亚洲和东南亚沿海地区的扩散路线。 小河居民用于发酵开菲尔奶酪的古代新疆菌株与现代西藏菌株则属于东亚支系,且古代新疆菌株位于该支系的基部位置,这说明开菲尔乳酸菌及其发酵技术存在另一条从新疆传播到西藏等东亚其他内陆地区的新的、独立的传播路线。 由此可知,欧亚大陆不同地区古人群在应用和驯化开菲尔乳酸菌的过程中,有过不同的迁徙和交流路线。 互“利”共“生” 人类与发酵微生物协同演化 人类和发酵微生物之间的协同演化是一个复杂而有趣的过程。以开菲尔乳酸菌为例,研究揭示出进化时间尺度上乳酸菌与人群互利共生、协同演化的分子机制。 相比于青铜时代的开菲尔乳酸菌菌株,现代菌株出现了与耐药机制、细菌自身免疫及减轻人类肠道炎症反应相关的基因簇,而这些功能元件的变化一方面是开菲尔乳酸菌面对环境压力的适应性演化,另一方面也是伴随人类活动、技术文化变迁以至人体肠道微生物环境适应等长期相互作用的结果。 同时,人类对开菲尔乳酸菌的偏好性驯化和传播,则相应推动了其自身饮食习惯和生产方式的转变及畜牧业的发展;通过发酵奶制品摄入的乳酸菌也帮助人类调节肠道的消化功能,对人类健康产生影响。 付巧妹团队历经十一年攻关探索,通过设计70余万个捕获探针,将开菲尔奶酪样品中的乳酸菌DNA从0.43%-0.55%富集提升至64%-80%,使得第一例古代发酵微生物的全基因组研究成为可能;而系统性的发酵古微生物基因组研究,更是直观地揭开了新疆小河居民对发酵微生物的应用驯化和传播交流历史,洞察了数千年来乳酸菌在长时间驯化条件下基因组功能元件的演变历程。
关于现代中国人的祖先来源,目前存在多种假说,包括非洲起源说、本土进化附带杂交说和东亚起源说,可简化为“单一地区演化”和“多地区演化”两种。这些观点尚未被实证,仍处于假说阶段。中国科学技术协会发布的2024重大科学问题中,也包括了“中国境内发现的古人类是否为现代中国人的祖先”这一前沿课题。 近几十年的人类起源探索中,基因研究与非洲起源说备受关注。尽管主流观点认为人类起源于非洲,但这一观点仍存在争议。考古发现显示,中国拥有连续传承的遗址和独特的生理特征,如铲形门齿,这些与非洲人的特征不同。同时,基因研究也提供了一些证据,如付巧妹团队确定4万年前的田园洞人具有东亚人基因。 然而,非洲起源说的主要证据来自基因研究,且存在争议。例如,复旦金力教授的研究支持非洲现代人6万年前走出非洲进入中国,但湖南“道县人”的存在时间却早于这一推算。此外,仅以M168的证据论证非洲起源并不充分,需要更多基因证据来支持。同时,不同基因理论与方法得出的结论也可能不同。 因此,尽管非洲起源说极为盛行,但它依然只是一种假说,尚未被证实。在探索人类起源问题上,实践是检验真理的唯一标准。无论是哪种假说,都需要经过实践的检验才能被确认为正确。在目前的科学探索中,我们仍需保持开放的态度,继续深入研究,以期找到更加准确和可靠的答案。
「科普冷知识」【「塔里木盆地发现最古老奶酪」】大约二十年前,科学家在塔里木盆地发现了一具木乃伊。在沙漠里发现一具木乃伊没有什么稀奇的,但木乃伊身边的白色固体却引起了科学家的兴趣。进一步研究发现,这些固体是奶酪! 近日,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹研究员在《细胞》杂志上发表了关于这一最古老的奶酪的研究报告。 研究人员成功从墓葬样本中提取到了线粒体DNA,并且在奶酪样本中发现了牛和山羊的DNA。更重要的是,科学家从乳制品样本中获得了开菲尔乳酸菌的DNA,这种菌在当今的开菲尔奶酪中都很常见,并确认这些白色物质就是我们现在仍在食用的开菲尔奶酪。 通过对古代奶酪中的细菌基因进行测序,研究小组进一步追踪了益生菌在过去3600年中的进化之路。他们发现,样本中的乳酸杆菌与藏族人群的关系更为密切,挑战了长期以来人们认为的开菲尔奶酪仅起源于现代俄罗斯北高加索山区的观点。 该研究还揭示了乳酸杆菌如何通过与相关菌株交换遗传物质,从而随着时间的推移提高其遗传稳定性和牛奶发酵能力。与古代乳酸杆菌相比,现代细菌更不太可能在人体肠道中引发免疫反应。这表明,长期的基因交换也帮助了乳酸杆菌在数千年的相互作用中更好地适应人类宿主。「千万IP创科普」@中国科普博览
古人是怎样发酵奶制品的?通过对迄今最早的奶酪制品——新疆小河墓地出土的“奶酪”样本进行研究,我国科研团队实现了国际首个古代奶制品遗存宏基因组研究。9月25日,相关研究成果在《细胞》杂志在线发表。 发酵是人类历史上最古老的利用微生物进行生产实践的行为,发酵奶制品可能是最早出现的发酵食品。不过,尽管人类食用发酵奶制品的历史悠久,但目前关于人类历史上对发酵微生物的应用和技术交流历史,以及发酵微生物本身的演化过程,特别是发酵微生物在长时间驯化条件下功能性基因的演变知之甚少。 围绕古代发酵奶制品,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹团队联合中国科学院大学人文学院教授杨益民,以及新疆文物考古研究所、新疆大学、国家文物局考古研究中心等单位,对新疆小河墓地出土的“最古老奶酪”展开了系统性古微生物基因组研究。 此前,“最古老奶酪”已通过古蛋白质组学被鉴定为开菲尔奶酪,它源自开菲尔酸奶,由类似酒曲的开菲尔粒在奶中发酵而成。然而,历经时间洗礼,其中的乳酸菌含量仅有0.43%—0.55%,很难捕获。付巧妹团队历经11年探索,自主设计了乳酸菌全基因组位点探针,从样本中捕获富集到64%—80%的乳酸菌,让古代全基因组研究成为可能。 科研团队从距今约3500年的3例古老奶酪样本中,提取出较高质量的古代开菲尔中的乳酸菌基因组,进一步确证该奶酪制品由开菲尔乳酸菌发酵生产。奶制品发酵技术的传播在很大程度上伴随着人类的迁徙和互动,样本中发现的微生物群落与欧洲菌株属于不同分支,这揭开了开菲尔乳酸菌另一条独立的、东亚内陆传播路线。 古人群通过食用发酵奶制品摄入大量发酵微生物,这些有益的共生微生物伴随着环境压力、人类活动、技术文化的变迁,通过长时间与人类体内其他肠道微生物群落的相互作用,其本身的基因组也发生了相应的演变。该研究通过探究数千年间开菲尔乳酸菌的适应性演化特点,同时反映出古人群与该共生微生物的协同演化历史。 微生物与人类的相互作用贯穿了人类数百万年的演化历史,数以亿计的微生物与人类共生,参与到人类体内营养的合成与毒素的分解,在人类健康及其与环境的高度互动中扮演了重要角色。科研团队表示,该研究以与人类活动和生业模式息息相关的共生微生物为突破口,用前所未有的古分子证据揭开过去人群对微生物的应用驯化和传播交流历史,从分子机制层面厘清相关菌株的引入、传播和演变历程,为深入理解相关人群技术文化的交流和发展,与环境高度动态的相互作用提供了全新思路和独特维度。 国际相关专家评价,“这是领域里很罕见的挖掘全新数据的古DNA研究”,“这一首例来自考古样本的共生微生物基因组意义重大,为欧亚草原中部人群的迁徙交流与微生物驯化历史带来新认识”。 【来源:北京日报】
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